发展心理学的研究表明，同卵双生子在跨时间、跨空间几十年，被不同人领养，成年之后依然在很多方面保持一致性。
小鱼儿与花无缺就是时间与空间。江枫和移花宫宫女月奴私奔，生下双子。最后被移花宫宫主所杀，其中花无缺被移花宫宫主邀月收为弟子。而小鱼儿则被燕南天带走，养在恶人谷中。
花无缺在移花宫宫主的教导下神功大成，明月神功出神入化。移花宫宫主多次制造花无缺与江小鱼的对立。江小鱼武功低微，只是在恶人的熏陶下懂得了江湖险恶，鬼主意多。两人共同喜欢上一个姑娘:铁心兰，铁心兰倾心江小鱼，但又与花无缺牵扯不清。三人的事被明月宫主看在眼里，明月宫主特意煽风点火、制造事端。
燕南天苏醒，原来燕南天当初到恶人谷之时遭受十大恶人暗算，故一直没有传授江小鱼武功。燕南天对江小鱼倾囊相授，兄弟对决。燕南天认出花无缺为江枫后人，两人是双胞胎。虽然分开抚养，两人表面性格不同，但骨子里的侠肝义胆不会变。两兄弟合力对抗明月宫主。
燕南天痛斥明月宫主:你表面借与我对抗，实则矛头对准他们，实乃攻于心计。明月宫主大笑，时空两人为上古余孽，本该以绝后患。你我之情堪比日月，奈何我身负重任，不得不出此下策。
明月宫主自刎，燕南天追随而去。小鱼儿把两人葬在一起。燕伯伯，你们俩人为了身上之任不能相守，从此在地下相爱，我和花无缺定不负你所望。从此，小鱼儿与花无缺带着各自的爱人共守世间。